乘坐更加舒适，乘坐空间和行李箱空间更大，发动机更加节能——这一切宣告了宝马X3第二代的登场。尽管第一代宝马X3在2003年的全球销售量已经达到了600000辆，但是购买者们依然有诸多抱怨，甚至有人抱怨内饰根本配不上宝马这个品牌！宝马公司汽车底座方面的专家汉茨-克鲁舍表示，他们认真听取了这些意见，而他可以保证，新一代的宝马X3绝对不会存在这些问题了。

第二代在车身比例上没有太多变化，同样的车灯配置以及相比X5系列更大的双肾型进气格栅。新一代X3车身长4648毫米，加长了78毫米，宽度为1881毫米，加宽了26 毫米，而高度则较之前一款降低了15毫米。

车轮距加长了20毫米从而提高了行驶的稳定性，内饰方面则加大了活动空间。腿部空间加宽了23毫米，肘部空间加宽了26mm，使得乘坐更舒适。后排座椅靠背能够以40:20:40的比例折叠，从而使行李空间从480升提高到550升，可随意开启或关闭行李舱盖。升高的座椅位置使出入更方便。驾驶和副驾驶座位间加宽了10毫米，也就使得仪表板相应加宽。

宝马X3的变速杆未作改变，而全新的智能驾驶控制系统iDrive则令人眼前一亮，总体来说第二代X3延续了宝马X系列的一贯风格。